С 1960 действует мемориал, открытый в честь 15-летия Победы над фашистской Германией – скульптура воина из бронзы со скорбно склонённой головой установлен при кладбищенском входе, где с 1942 года и на протяжении всей войны проводились погребения советских воинов, умиравших в эвакогоспиталях Томска от ран. Военные захоронения располагаются на двух участках. Вдоль центральной линии кладбища и возле главного входа оформлено 300 могильных холмиков, каждый из которых венчает стела. На стелах указаны имена и воинские звания захороненных. Всего военных захоронений здесь находится 939, из них известны только 674 фамилии.
В братской могиле захоронены 20 курсантов Томского артучилища, которые погибли, исполняя служебные обязанности.
В 1966 году Южное кладбище объявлено особо охраняемой мемориальной зоной. А к 30-летию Победы здесь был открыт некрополь. Авторами некрополя стали томские архитекторы <nobr>Яковлев Н. К.</nobr>, <nobr>Новиков В. Р.</nobr>